查理二世也破坏了对内战参加者实行大赦的保证。复辟政权把革命的积极参加者、共和主义者、激进分子和参加人民运动的人都当作“弑君者”，排斥在大赦之外，加以残酷迫害。保王党人甚至不放过已经死去的革命者。1661年1月底，他们把克伦威尔、爱尔顿和布雷德肖的尸体从坟墓中挖出来挂在威斯敏斯特宫前的杆子上示众，以发泄他们对革命者的仇恨。许多革命者为逃避迫害，被迫流亡国外。复辟政府也未遵守维护新土地所有者权利的保证。政府法庭宣布，出售革命时期没收的土地是非法的。相当一部分教会和贵族的土地回到原来所有者手中，一些新所有者仅被承认为土地的长期租佃人。
复辟政府实行不利于本国资产阶级的对外政策。17世纪70年代，英国商业竞争对手荷兰的商业实力已开始衰落，强大的法国上升为商业和争夺殖民地的主要竞争者。查理二世为获得法国政治上和经济上的支持，不惜牺牲本国的民族利益，实行亲法的对外政策。1662年，查理二世和他的大臣把克伦威尔在大陆上夺取的战略要地敦刻尔克卖给法国。1670年5月26日，政府背着议会，与法国在多佛尔签订秘密条约，查理二世答应在条件具备时，在英国正式恢复天主教，法王路易十四则保证，在英国发生“骚乱”时派军队援助英国王。英王还承担义务同法国一起对英国的盟国荷兰进行战争，并支持路易十四实现获取西班牙王位继承权的计划，帮助法国实行对外掠夺。