己亥扈圣驾南巡，至卫辉府，白昼有旋风绕驾不散，上问仲文何祥，对曰：『主火。』上遣仲文禳之，仲文奏曰：『火终不免，第谨护圣躬耳。』是夜行宫果灾，宫中死者亡算，上仅以身免，即日敕行在吏部授仲文神霄保国宣教高士。
上体素羸，步履少囏，一日问仲文：『卿何术祈祷取验？』仲文因劝上玄修保元神，主于清静宁一，则法无不验。自是上退居迎和宫，辄事秘祷，以祈天永命。岁余，进神霄保国弘烈宣教振法通真秉一真人，领道录事，食正二品俸。寻加少保、礼部尚书，又加少傅，余官若故，食正一品俸。俄进少师、少傅兼少保、礼部尚书、神霄保国弘烈宣教振法通真忠孝秉一真人，知道录事若故。前此大臣无兼总三孤如仲文者。寻又改神霄紫府阐范保国弘烈等号，知道录事，少师、少傅兼少保、礼部尚书若故，勋阶特进光禄大夫柱国，又兼支大学士俸，寻支伯俸。
二十九年春不雨，上问仲文：『何以久不雨？』仲文曰：『疑有冤狱。』时河间人王联以忤逆抵极刑，因诬奏原问官故巡抚副都御史胡缵宗等以诗诽谤，诏逮治之，考讯久，亡状，上释之。是夜漏下四鼓，大雨，明日召吏部尚书夏邦谟至迎和门授敕，敕曰：『礼部尚书兼真人陶仲文祷雨济旱，力赞平狱，特封为恭诚伯，赐诰，?禄一千二百石。』八月降敕，岁加禄米一百石，仲文疏辞，上曰：『卿祝厘保国，祷祈雨旸，累累效职。若鞫狱，非卿职也。果专恭太上，尽职玄修，虽数爵，亦未克酬。今以平狱谢，似非宜，且准辞。』