我国目前教育信息化建设存在基础设施投入高，产出效益低的问题。究其原因在于我国教育信息化应用水平仍有待提高，其主要表现在信息化应用意识不强，信息化应用技能较差，信息化应用效率较低，信息技术与教学科研结合不够紧密，信息资源和应用系统的开发利用对学科建设、提高教育质量的支撑不足。
教育信息化在教育行政管理方面应用效果显著，但在学科建设和教学质量提高方面还远远没有达到应有的水平。不少地方出现了信息化资源严重浪费，设备闲置、软件功能过剩的情况。
教育信息化基础设施应用效率的提升受以下几个主要因素的影响：（1）各地对教育信息化认识水平参差不齐，有些地方把教育信息化当作政绩陈列和形象工程；（2）教育信息基础设施及应用缺乏可持续的规划和保障；（3）教育机构的教育信息资源难以共享，网络间的互联互通瓶颈降低了资源的应用效率。