千百年来，关于司马迁的死因一直是个谜。有人认为司马迁善终，但也有人认为司马迁死得不明不白，大有疑问。认为司马迁系善终的人认为，据《汉书》本传载：“迁既被刑之后，为中书令，尊宠任职。”受汉武帝“尊宠”并重用，说明死于武帝之手的可能性很小，因此应是善终。但有很多人不同意这种看法，他们认为司马迁是被武帝杀死的，而对于他的具体死因，这些人又有不同意见。有人认为，司马迁是由于作《报任安书》而被杀死的，原因是武帝认为司马迁在“发怨言”，一怒之下下令处死了司马迁。另外有人认为，司马迁可能死于汉武帝晚年的“巫蛊之狱”。当时，身为武帝宠臣的江充与太子有宿怨，恐武帝归天后被太子诛杀，于是就借查处巫蛊案之机诬陷太子。太子杀江充后自杀，武帝发觉太子冤死，就大治太子死之。这场灾难牵涉到许多文武官员，司马迁估计也难以幸免。
·生命绝响
司马迁究竟以何种方式告别了人世呢？事实上，在受刑之后，司马迁已经很少进行活动，他几乎把所有精力都放在了创作《史记》上。在公元前90年左右《史记》完成后，他的心愿已了，这个世界还有什么能令他留恋的呢？至于这位太史公的归宿，想来性情刚烈的他，是不会再流连于人世了吧？